Medtem ko npr. pri gastroskopiji natančno pregledamo notranjo površino prebavil, EUZ omogoča pogled v globino, tako da lahko pregledamo celotno debelino stene prebavil.
Uporabljamo ga za pregled zgornjih prebavil (požiralnik, želodec, dvanajsternik) ali spodnjih prebavil (zadnji del debelega črevesa – danka). Možen je tudi pregled nekaterih organov, ki obdajajo prebavila (jetra, trebušna slinavka, žolčne poti, žolčnik …).
Preiskava se izvaja s tanko, upogljivo cevjo, imenovano endoskop, ki ga zdravnik izvajalec, pod kontrolo očesa, uvede preko ust ali zadnjika do mesta, ki nas zanima. Nato vključi ultrazvočno pripravo, ki ustvarja ultrazvočne valove, s pomočjo katerih nastaja slika tkiva ali organa, ki ga pregledujemo.
Preiskavo opravlja zdravnik gastroenterolog – endoskopist, vrhunsko usposobljen specialist za tovrstne preiskave.