Sebastian Stefanović je v Diagnostičnem centru Bled zaposlen od leta 2021. Specialistični izpit na področju gastroenterologije je s pohvalo opravil 29. oktobra 2021. Avgusta leta 2018 je opravil izpite USMLE (The United States Medical Licensing Examination) in pridobil certifikat ECFMG. Novembra leta 2019 je pod mentorstvom prof. dr. Petra V. Draganova na University of Florida opravljal dodatno izobraževanje na področju naprednih endoskopskih tehnik.
V gastroenterološki ambulanti Diagnostičnega centra Bled izvaja specialistične preglede in endoskopski preiskavi gastroskopijo in kolonoskopijo. Od novembra 2021 je tudi tajnik Slovenskega združenja za gastroenterologijo in hepatologijo.